國家海洋局第三海洋研究所（簡稱海洋三所），創建于1959年11月27日，隸屬于國家海洋局，位于美麗的廈門市東海之濱，是國家公益類綜合型海洋科學研究機構。
海洋三所目前擁有員工470多人，招收和聯合培養在讀碩、博士研究生160多人。職工中有中國工 程院院士1人，國家杰出青年基金獲得者1人，享受政府特殊津貼專家20余人, 入選國家“百千萬人才工程”2人，入選福建省“百千萬人才工程”3人，廈門市拔尖人才3人，副高級職稱以上科技人員126人，具有碩士、博士學位人員 224人。海洋三所是1984年國務院學位委員會批準的碩士學位授予單位，并與清華大學、中國科技大學等高校聯合招收博士研究生，現建有博士后科研工作 站。
海洋三所擁有4大研究領域，16個研究方向，13個研究部門（含2個國家海洋局重點實驗室,1個 國家海洋局工程技術中心，依托我所建有 APEC海洋可持續發展中心）。建所50多年來，面向國家需求和國際海洋科學前沿，我所在深海微生物及生物基因資源研究，海洋與全球變化研究，南北極研 究，海洋生物多樣性與生態環境保護研究，海洋環境監測技術研究，海洋放射性與海洋核應急技術研究，海洋化學、水文、地質、遙感與聲學、海島、海岸帶資源開 發利用與保護規劃，海洋生態修復技術研究，海洋生物制藥與保健品研發等領域具有特色，開展了大量的基礎性、應用性和戰略性研究工作，成為海洋強國建設和科 技興海事業的重要科技力量。
近五年來，海洋三所先后承擔完成包括國家“863”、“973”、自然科學基金、重大國家專項在 內的縱向科研項目700多項，已發表論文 1800多篇，其中SCI、EI收錄近400篇，出版各類專著、大型調查報告百余部，獲得國家自然科學獎1項，國家科技進步獎2項，省部級科技進步三等獎 以上70多項，申請并獲得授權專利100多項，部分成果達國際先進水平。
海洋三所廈門所部占地面積6.3萬平方米，科研實驗與辦公用房3萬平方米，現有各類先進的海洋儀 器設備2億多元，其中大型海洋調查儀器設備570余臺件、大型實驗室分析系統46個；館藏中外科技書刊8萬多冊，主辦中國自然科學核心期刊《應用海洋學學 報》，是國家海洋標準委員會生物資源開發與保護分技術委員會、中國生態學會海洋生態專業委員會依托單位。擁有我國迄今為止最大的灰鯨標本和十萬多份館藏生 物標本、擁有國家級深海微生物資源庫。海洋三所漳州科技興?；卣嫉孛娣e145畝，第一期工程正在建設中，該基地將為海洋藥物與公共健康產品研發中試提供 重要條件；4500噸級的海洋科學綜合調查船“向陽紅3號”正在建造中；以海洋中藥材培育技術為重點的漳州東山海洋生物資源研發基地正建設啟動中。
海洋三所所持有《實驗室資質認定證書》、《ISO9001：2008 質量管理體系認證證書》、甲級《海域使用論證資格證書》、甲級《建設項目環境影響評價資格證書》、甲級《工程勘察證書（海洋工程勘察綜合類）》、甲級《工 程設計證書（海洋工程設計 - 沿岸工程）》、乙級《工程咨詢單位資格證書 - 生態環境與建設工程》、乙級《地質勘察資質證書》、乙級《環境工程設計證書》等各類技術服務證書，在海洋發展規劃、環境保護規劃和重大基礎建設等方面的海 洋管理和海洋經濟發展提供了大量的基礎性、支撐性技術服務，為我國經濟建設、國家安全和海洋科學技術的發展做出了突出貢獻。