2021年，重慶理工大學在15個一級學科碩士學位授權點，及電氣測試技術與儀器、會計學等45個二級學科碩士學位授權點，4個工程碩士培養類別、1個工商管理碩士（MBA）授權點、1個會計碩士授權點、1個審計碩士授權點、1個應用統計碩士授權點、1個資產評估碩士授權點、1個藥學碩士授權點。
| 二級單位名稱 | 招收研究生學科、專業名稱 |
| 車輛工程學院 | （全日制）0802機械工程★（080204車輛工程、0802Z2地面武器機動工程） |
| （全日制）0855機械（車輛工程）（專業學位） | |
| 機械工程學院 | （全日制）0802機械工程★ |
| （全日制）0804儀器科學與技術★ | |
| （全日制）0855機械（機械工程）（專業學位） | |
| 材料科學與工程學院 | （全日制）0805材料科學與工程★ |
| （全日制）0856材料與化工（材料工程）（專業學位） | |
| 電氣與電子工程學院 | （全日制）0804Z2電氣測試技術與儀器 |
| （全日制）0810信息與通信工程★ | |
| （全日制）0858能源動力（電氣工程）（專業學位） | |
| （非全日制）0858能源動力（電氣工程）（專業學位） | |
| （全日制）0854電子信息（光學工程）（專業學位） | |
| （非全日制）0854電子信息（光學工程）（專業學位） | |
| 計算機科學與工程學院 | （全日制）0812計算機科學與技術★ |
| （全日制）0854電子信息（計算機技術）（專業學位） | |
| （非全日制）0854電子信息（計算機技術）（專業學位） | |
| 藥學與生物工程學院 | （全日制）0831生物醫學工程★ |
| （全日制）1007藥學★ | |
| （全日制）0854電子信息（生物醫學工程）（專業學位） | |
| （非全日制）0854電子信息（生物醫學工程）（專業學位） | |
| （全日制）1055藥學（專業學位） | |
| （非全日制）1055藥學（專業學位） | |
| 化學化工學院 | （全日制）0817化學工程與技術★ |
| （全日制）0856材料與化工（化學工程）（專業學位） | |
| 理學院 | （全日制）0701數學★ |
| （全日制）0714統計學★ | |
| （全日制）0803光學工程★ | |
| （全日制）0854電子信息（光學工程）（專業學位） | |
| （全日制）0252應用統計碩士（專業學位） | |
| 會計學院 | （全日制）120201會計學 |
| （全日制）1253會計碩士（專業學位） | |
| （非全日制）1253會計碩士（專業學位） | |
| （全日制）0257審計碩士（專業學位） | |
| 管理學院 | （全日制）1202工商管理★（120202企業管理、120203旅游管理、120204技術經濟及管理） |
| （全日制）1201管理科學與工程★ | |
| 經濟金融學院 | （全日制）0202應用經濟學★ |
| （全日制）0256資產評估碩士（專業學位） | |
| （非全日制）0256資產評估碩士（專業學位） | |
| 馬克思主義學院 | （全日制）0305馬克思主義理論★（030501馬克思主義基本原理、030503馬克思主義中國化研究、030505思想政治教育） |
| 重慶知識產權學院 | （全日制）1202工商管理★（1202Z1知識產權管理） |
| MBA教育中心 | （全日制）1251工商管理碩士（MBA）（專業學位） |
| （非全日制）1251工商管理碩士（MBA）（專業學位） | |
| 兩江國際學院（中外合作辦學項目） | （全日制）0810信息與通信工程★（重慶兩江KAIST國際項目） |
| 重慶兩江人工智能學院 | （全日制）0812計算機科學與技術★（081203計算機應用技術） |
| （全日制）0854電子信息（計算機技術）（專業學位） |
（一）全日制碩士研究生：
學術學位研究生（不含藥學碩士）：7000元/生.年。
藥學碩士（學術學位）：8000元/生.年。
專業學位研究生：9000元/生.年（不含MBA、MPAcc、審計碩士）。
工商管理碩士（MBA）、會計碩士（MPAcc）、審計碩士：13000元/生.年。
信息與通信工程專業★（中外合作辦學項目）（081001通信與信息系統、081002信號與信息處理）：38000元/生.年。
（二）非全日制碩士研究生：
藥學碩士:9000元/生.年。
資產評估碩士：10000元/生.年。
電子信息（原計算機技術、光學工程、生物醫學工程等領域）：10000元/生.年。
能源動力（原電氣工程領域）：11000元/生.年。
工商管理碩士（MBA）：13000元/生.年。
會計碩士（MPAcc）：23000元/生.年。
（三）住宿費標準：1200元/生.年。學校有安排錄取學生在兩個校區就讀的權力。
